Paso 1: El servidor. Ejecutar como root lo siguiente:

Instalar paquetes de NFS, SSH y compiladores
$ apt-get install nfs-kernel-server openssh-server build-essential

Instalar MPICH2
$ wget http://octopus.inf.utfsm.cl/fsaravia/files/herramientas/mpich2_1.1.1p1-1ubuntu_amd64.deb
$ dpkg -i mpich2_1.1.1p1-1ubuntu_amd64.deb

Crear un usuario (en este caso “mpi”), con un uid fijo
$ adduser mpi --uid 1002

Crear claves DSA para conectarse por ssh sin password
$ ssh-keygen -t dsa

Exportar por NFS el $HOME del usuario mpi, agregando en el archivo /etc/exports lo siguiente:
$ /home/mpi 192.168.5.0/24*(rw,no_root_squash,sync,no_subtree_check)

Luego aplicar los cambios:
$ exportfs -av

Por simplicidad, agregar los nodos de la red en /etc/hosts. La separación entre las direcciones IP y el nombre de cada host debe ser un tabulador y no espacios.
192.168.5.70 pc001
192.168.5.116 pc002
192.168.5.78 pc003
192.168.5.77 pc004


Esto es todo lo que se debe realizar como root.

Ahora acceder como usuario mpi y configurar la cuenta para trabajar como cluster:

En el archivo /home/mpi/mpd.hosts poner los nombres de todos los equipos que forman parte del cluster:
pc001
pc002
pc003
pc004

Luego crear el archivo /home/mpi/.mpd.conf donde va la “clave” del cluster:
$ echo algunapalabra > /home/mpi/.mpd.conf
$ chmod 600 /home/mpi/.mpd.conf

Finalmente, crear claves DSA para acceder por SSH sin clave. Por seguridad no utilizar las mismas de root.
$ ssh-keygen -t dsa

Listo. Con esto tenemos el pc servidor configurado.

Paso 2: Equipos esclavos

Ejecutar como root lo siguiente:

Instalar paquetes de NFS, SSH y compiladores
$ apt-get install nfs-kernel-server openssh-server build-essential

Instalar MPICH2
$ wget http://octopus.inf.utfsm.cl/fsaravia/files/herramientas/mpich2_1.1.1p1-1ubuntu_amd64.deb
$ dpkg -i mpich2_1.1.1p1-1ubuntu_amd64.deb

Crear un usuario (en este caso “mpi”), con un uid fijo
$ adduser mpi --uid 1002

Copiar el archivo /etc/hosts del servidor al equipo esclavo
$ scp root@pc001:/etc/hosts /etc

Configurar el $HOME del usuario mpi para que se monte vía NFS desde el servidor, agregando la siguiente línea al archivo /etc/fstab
pc001:/home/mpi /home/mpi nfs defaults,auto 0 0

Luego, eliminar el contenido local del directorio /home/mpi y montar vía NFS:
$ rm -rf /home/mpi/*
$ mount -a

Con esto queda configurado el cliente.

Consideraciones finales:

Desde el servidor y como usuario mpi conectarse por ssh a todos los nodos, para que quede como “conocido” y guardado en ~/.ssh/known_hosts.

Una vez realizado esto, es posible levantar un cluster MPI con todas las de la ley:
$ mpdboot -n 4 -f ~/mpd.hosts

Si no hay ningún mensaje de error se puede visualizar una lista de los nodos que forman parte del cluster
$ mpdtrace

Y finalmente, para ejecutar código C++/MPI
mpirun -np 8 ./programa_mpi
En el ejemplo, hay 4 máquinas dual-core, es decir, 8 cores en total.

Seguramente me faltan algunos detalles. Información más detallada y otros tips en los siguientes sitios:
http://allintech.info/2008/09/a-ubuntu-mpi-cluster-part-1-server-setup
http://www.glib.org.mx/article.php?story=20070320133500387

Una posible causa de errores puede ser que el nombre del equipo (hostname) no coincida con lo que dice /etc/hosts

Probado con máquinas Kubuntu 9.10 alpha, Ubuntu 9.04, centos 5.3, centos 5.2.

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Pasos:

abrir la consola y con sudo poner al final de /etc/bash.bashrc

JAVA_HOME=/usr/lib/jvm/java-6-sun
export JAVA_HOME
PATH=$PATH:$JAVA_HOME/bin
export PATH

y listo tenemos configurado ahora nuestro java correctamente, reinicia y luego prueba si esta el link…

foward@foward-laptop:~$ echo $JAVA_HOME
/usr/lib/jvm/java-6-sun
foward@foward-laptop:~$ echo $PATH
/home/foward/bin:/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/sbin:/bin:/usr/games:/usr/lib/jvm/java-6-sun/bin

Saludos!!!
proximamente mas JAVA TIPS!

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